自行開車 (國道路線)
南下：
沿國道一號南下 → 下大灣交流道右轉 → 沿復興路 → 接小東路 → 直走即可抵達本院。
【自國道三號南下者，轉國道8號（西向），可接國道一號（南向）】
北上：
沿國道一號北上 → 下仁德交流道左轉 → 沿東門路(西向)往台南市區直走 → 遇中華東路右轉(北向) → 於小東路口左轉，直走即可抵達本院。
【自國道三號北上者，轉86號快速道路（西向），可接國道一號（北向）】
搭乘火車
於台南站下車後，自後站出口走大學路→ 勝利路左轉→遇小東路右轉約100公尺，左側即為醫學院成杏校區入口。
搭乘高鐵
搭乘台灣高鐵抵台南站者，可轉搭台鐵電車抵達台南火車站，自後站出口走大學→遇勝利路左轉→遇小東路右轉約100公尺，左側即為醫學院成杏校區入口。